Mesmo com o avançado filtro de ruído fornecido pelo sistema de sonar, temos de enfrentar o desafio do ruído.Isto é importante durante o planeamento e a preparação da instalação do sistema.Os ecos de quaisquer alvos grandes e pequenos têm de ser detetados dentro do ruído.
É importante manter o nível de ruído o mais baixo possível.Isto é necessário para obter interpretações de ecos de longo alcance e fiáveis.